マクロで「し」「ぃ」を登録し、L+Gキーに割り当てる必要がある
合っています。拗音付きかな文字は、他のかな文字と同様内部プログラムに直接定義されています。「かな」タブに無い組み合わせを作るには、一つ一つマクロを定義するしか方法がありません。
本来の拗音(1モーラで発音されるもの)については、日本語で実際に使われるものを網羅的に入れたつもりですが、長音と同じ発音になる「しぃ」などや、ほとんど使われることのない「きぇ」などは定義に入れていません。技術的に難しいことではありませんが、カスタマイズ画面がさらにややこしくなるので除外しました。蜂蜜小梅配列など拗音定義が規則的な配列だと定義されている場合があるようですね。