ご返信ありがとうございます。
当初かえうちパートナーを実行しても何故か立ち上がらず、親指シフトになりませんでした。
何度もかえうちパートナーの実行を繰り返すうちにかえうちパートナーが立ち上がり、親指シフトになりました。
しかしWindowsを終了すると次の起動時にかえうちパートナーが立ち上がらず、手動起動が必要でした。
かえうちパートナーは常駐しないんですね、と書いたのはそのためです。
それから再度手動起動させると以降常駐するようになりました。
先程も確認しましたが、私の環境下ではかえうちパートナーが起動してないと親指シフトにはならず、ローマ字入力になってしまいます。親指シフトにするにはかえうちパートナーが必須です。
かえうちパートナーがなかなか常駐しなかったことを含め、理由はわかりません。
目下の悩みはかえうちの立ち上がりのタイムラグと親指シフトキーのつもりで押した打鍵が変換キーの打鍵と感知される点です。